Mgr. Jan Pačes, Ph.D.

Jsem molekulární genetik a bioinformatik v Laboratoři genomiky a bioinformatiky Ústavu molekulární genetiky AV ČR. Vystudoval jsem biochemii na PřF UK a mikrobiologii na VŠCHT, kde přednáším bioinformatiku. Zabývám se strukturou genomů, zejména lidskými endogenními retroviry. Jsem koordinátorem infrastruktury ELIXIR-CZ a členem výboru ELIXIR Heads of Nodes. Popularizuji biologii v Českém rozhlase (Jak to vidí..., Meteor, Laboratoř) a na přednáškách pro školy a veřejnost.

Kontakt: hpaces@img.cas.cz

Molecular geneticist and bioinformatician at the Laboratory of Genomics and Bioinformatics, Institute of Molecular Genetics of the Czech Academy of Sciences, and lecturer in bioinformatics at UCT Prague. I study genome structure, especially human endogenous retroviruses, coordinate ELIXIR-CZ and serve on the ELIXIR Heads of Nodes Committee.

ORCID | ResearcherID | Google Scholar | LinkedIn | Bluesky | ÚMG | Studium bioinformatiky | Wiki

Projekty: HERVd (databáze lidských endogenních retrovirů) | AmtDB (databáze starověké mitochondriální DNA) | Pathogen Portal CZ (data ze surveillance patogenů) | COG-CZ (genomická surveillance koronaviru)

Vybrané publikace

• Šúri T, …, Kolář M, Pačes J: Developing molecular surveillance of SARS-CoV-2 in the Czech Republic (2021–2022). Sci Rep 15:19690, 2025
• Ehler E, Novotný J, Juras A, Chyleński M, Moravčík O, Pačes J: AmtDB: a database of ancient human mitochondrial genomes. Nucleic Acids Res 47:D29–D32, 2019
• Hron T, Pajer P, Pačes J, Bartůněk P, Elleder D: Hidden genes in birds. Genome Biol 16:164, 2015
• Pačes J, Pavlíček A, Zika R, Kapitonov VV, Jurka J, Pačes V: HERVd: the Human Endogenous RetroViruses Database: update. Nucleic Acids Res 32:D50, 2004

Všechny publikace na Google Scholar.

Kursy a přednášky

• VŠCHT: Genomics: analysis and algorithms česky září - prosinec 2026
• VŠCHT: Fylogenomika a populační genetika česky září - prosinec 2026

Kalendář

Přednášky pro veřejnost

Na školy a pro veřejnost přednáším rád, napište.

• Noc vědců: září 2026
• Colours of Ostrava: červenec 2026
• Život 90: duben 2026
• Den otevřených dveří: listopad 2025
• Agora: březen 2025
• Týden Akademie věd: listopad 2024

V rozhlase

• ČRo Plus, Laboratoř: Půdní živočichové a klima říjen 2026
• ČRo Plus, Laboratoř: Krajina bez lidí září 2026
• ČRo Dvojka, Meteor: Mikrobiom a alergie září 2026
• ČRo Dvojka, Meteor: Limity klonování srpen 2026
• ČRo Dvojka, Meteor: Zombie buňky květen 2026
• ČRo Dvojka, Jak to vidí: Hantavirus květen 2026
• ČRo Dvojka, Meteor: Vyvíjí se ještě člověk? květen 2026
• ČRo Dvojka, Meteor: Prodloužení života březen 2026
• ČRo Dvojka, Jak to vidí: Očkovací politika státu březen 2026
• ČRo Dvojka, Meteor: Nejmenší genom březen 2026

Média

• DVTV: Loď s hantavirem a největší strašák chřipka květen 2026
• Seznam Zprávy: Vakcína DNA nezmění (posudek v případu Kotlár) únor 2026
• Zdravotnický deník: Policie obvinila Kotlára, vaz mu zlomil český posudek únor 2026
• iROZHLAS: Očkovací politika a krize důvěry ve vědu březen 2026
• ČT24, Mimořádné pořady: Země v nouzi – život s koronavirem 2021
• YouTube: Pokud se naočkuje celá dospělá populace, virus se bude šířit jen mezi dětmi 2021
• Vesmír: moje články: Minimální genom; Signál a šum v DNA (2023); Cesta do pravěku (2023); Ty druhé viry v našem genomu (2017)

Minule

• VŠCHT: Genomics: analysis and algorithms česky září - prosinec 2025
• VŠCHT: Fylogenomika a populační genetika česky září - prosinec 2025
• VŠCHT: Případové studie česky / anglicky září - prosinec 2025
• VŠCHT: Genomics: analysis and algorithms english September - December 2024
• VŠCHT: Fylogenomika česky září - prosinec 2024