Případové studie z bioinformatiky


Místo a čas:

zimní semestr, pondělky 14:00 - 14:30, VŠCHT budova B, posluchárna B1322

Anotace:

Ukázka řešení nějakého konkrétního bioinformatického projektu (problému). Proč se řešil zrovna daným způsobem, jaké problémy se v průběhu vyskytly a jak se je podařilo (či nepodařilo) vyřešit. Volba programů / algoritmů s důrazem na výhody a nevýhody. Detailněji popsat konkrétní zvolené technické řešení. Co by šlo příště udělat lépe, možné alternativní způsoby řešení.

Informace pro přednášející:

Přednášky a případná diskuze jsou neformální. Studenti (sudují Mgr. oboru Bioinformatika) umí: programovat, statistiku, biologii a molekulární genetiku, dále bioinformatické algoritmy, databáze. Trochu běžný bioinfo software. Přednášky nahráváme, pouze zvuk a slidy, ale tím pádem z našeho notebooku, takže přednášku prosíme přinést na USB. Nahrávku mají studenti jako studijní materiál, dáváme k dispozici i prezentaci, takže prosíme pouza takové slidy, které můžete dát z ruky. Potřebujeme také kratičkou anotaci přednášky (nebo dobrý delší název) na web. Dobrý by byl předposlední slide: Jak to celé dopadlo: článek nebo program nebo metoda nebo třeba i neúspěch. A poslední slide: Take home message.

Zápočet

U zkoušky si student vybere jeden z projektů, zhodnotí z hlediska svých znalostí a navrhne, jak by takový problém řešil sám, jaké alternativní přístupy by byly možně, nebo jaká doplňková data/metody/programy by se s výhodou daly použít.


Prezentace


Time-stamp: <2021-11-03 15:32:38 (hpaces)>