Genomika: analýza a algoritmy - Cvičení

Kroky ke spuštění VM

• založit si účet na METACENTRU pro použití cloudu
• vygenerovat si pár ssh klíčů
• přiložit veřejnou část klíče ke svému účtu
• poslat na hpaces@img.cas.cz (Subject: GAA +info) login (email, jméno), pod kterým jste v metacentru
• po přidání do skupiny bioconductor si skupinu bioconductor zkontrolovat nebo nastavit v cloudu jako primární
• spustit VM bioconductor
• připojit se pomocí příkazu:
  • ssh login@x.x.x.x
  • kde x.x.x.x je ip vašeho spuštěného stroje

Medaile

Pavlína Slavníková za hledání v databázích

Data k úkolům

Primárně jsou data uložena na virtuálním stroji v /data/shared/GAA.

• Cvičení 1. (11. 10.)
• Cvičení 2. (18. 10.)
• Cvičení 3. (25. 10.)
• Cvičení 4. (1. 11.)
• Cvičení 5. část 1 část 2 (8. 11.)
• Cvičení 6. (15. 11.) část 2
• Cvičení 7. (29. 11.)
• Seminární práce